Le Bureau National, un organe politique
Le Bureau National est l'instance politique de La Cé. Il est chargé de mettre en oeuvre les orientations prises en congrès ou lors des Conseils Nationaux. Les membres du Bureau National sont élus tous les deux ans en Congrès par les délégués. Issus des associations
locales ou membres de la commission exécutive ils assurent leur mandat fort de leur expérience syndicale en tant que responsables nationaux de la Cé. Le Bureau National est une instance de décisions collective dont les membres ne représentent pas leur association.

Le Conseil National
Le Conseil National est une instance de débat sur le bilan des actions menées par la Cé nationalement dans les universités. Il définit les grandes orientations à venir. Le Conseil National est composé des membres du bureau national et des présidents des différentes associations locales qui débattent entre eux. Il est ouvert à tous les militants.

Le Congrès
Le Congrès est le moment ou les délégués des associations locales dressent un bilan et une analyse sur l’activité syndicale de la Cé durant les deux années écoulées et valident le rapport d’activité. Il fixe les enjeux, les grandes orientations et les objectifs de la Cé pour les deux années à venir.
Il élit notamment le bureau national qui sera chargé de la mise en œuvre de ces décisions.

La commission exécutive, une gestion quotidienne
La Commission Exécutive est l'organe de gestion quotidienne de la Cé. Elle met en œuvre les décisions prises par le Bureau National. Elle se compose des membres du bureau national élus à cet effet en Congrès tous les deux ans.

L’association locale, agir dans son établissement
L'association locale affiliée organise les adhérents de la Cé sur un établissement d’enseignement supérieur. Il existe une association locale par établissement.
Elle constitue le lieu quotidien d’action des adhérents, qui la font vivre par leurs actions, leurs initiatives.
Elle est souveraine sur son champ, c’est le niveau d’action de proximité de la Cé.